鎌倉時代、源頼朝より越中国（新川（にいかわ）郡・砺波（となみ）郡）を領地として与えられた宮道親直（みやぢちかなお）は、京都よりこの蜷川の地に移って城を築き、蜷川（にながわ）と姓も改めた。
建久八年（1197）にその蜷川氏元祖である親直を弔うため、嫡子蜷川五郎親綱（ちかつな）が黒崎の地に一寺を建立したのが当寺の始まりである。
以後、蜷川氏代々の菩提所（ぼだいじょ）として、室町時代には一休禅師との親交もあり、臨済宗（りんざいしゅう）であったという。
明応年間（1492～1501）、一族の蜷川八郎親貞（ちかさだ）が出家して独歩慶淳（どっぽけいじゅん）と称し、師僧の亀阜豊寿（きふほうじゅ）を新たに開山に迎え、自らは二世となって曹洞宗（そうとうしゅう）に改宗をする。
永正三年（1506）、守山（もりやま）の神保（じんぼ）氏との戦で越中蜷川氏は敗れ、その際に蜷川城も落城する。当寺も天正十年（1582）に越後上杉氏の戦火で焼失するが、その後、城址に諸堂が復興される。
元禄年間（1688～1704）には、富山藩から寺領も受け隆盛を極めていたが元治元年（1864）に再び本堂・庫裡などを失ってしまう。明治五年に伽藍（がらん）が再興されて修復を重ね今日に至る。
山号は、瑞龍山（ずいりゅうざん）。寺紋は、蜷川氏由来の右三つ巴。本尊の釈迦牟尼仏（しゃかむにぶつ）はじめ、県指定文化財の阿弥陀仏（あみだぶつ）、鎌倉開創時本尊である弥勒尊仏（みろくそんぶつ）と、過去現在未来の三世仏（さんぜぶつ）（阿弥陀・釈迦・弥勒）が安置される。一休禅師ゆかりの火消（汗かき）地蔵尊や蜷川氏代々の墓碑などがある。